Euskotren a rédigé une Politique environnementale définissant le cadre de référence pour le déploiement de la vision stratégique environnementale ; son objectif est de préserver la qualité de vie actuelle et future des citoyens en garantissant un environnement d'air, d'eau et de sol propres et sains via la gestion responsable des ressources naturelles et la gestion adéquate des déchets produits. L'entreprise souhaite ainsi limiter l'impact sur le changement climatique en facilitant le respect de la biodiversité et la fonctionnalité des systèmes écologiques.
En 2021, Euskotren a dépensé environ 966 925 euros (939 246 en 2020) dans la protection de l'environnement, un montant qui couvre à la fois les dépenses liées à la prévention et à la réduction des dommages à l'environnement générés par son activité, ainsi que celles dérivées des engagements environnementaux acquis volontairement par l'organisation.
Euskotren a intégré dans son patrimoine plusieurs éléments et mesures visant à favoriser l'économie et l'utilisation efficace des ressources en mettant en place des mesures d'efficience énergétique telles que la modernisation des systèmes d'éclairage et l'amélioration de la station de lavage de ses installations à Zumaia, ainsi qu’en promouvant l’utilisation d’énergies renouvelables avec l'achat d'une camionnette électrique.
La société a en outre acquis des équipements de stockage des produits et de détection automatique des fuites et mis en place des mesures de prévention et de recyclage des déchets pour contribuer à la protection et à l'amélioration de l'environnement dans le développement de l'activité de la société.
Elle a passé un appel d’offres pour l'achat de deux autobus à technologie hybride et deux autres autobus et deux minibus électriques, ainsi que quatre autres autobus conformes à la norme Euro VI sur les émissions des véhicules qui favorise la substitution des carburants à base de pétrole dans le but d’éviter ou du moins réduire l'émission de gaz à effet de serre et de certains polluants dans l'atmosphère et favoriser ainsi la qualité de l'air local.
La dernière unité de tramway de la Série 600 a également été intégrée dans la flotte. Les unités de cette série sont équipées d’améliorations techniques pour renforcer l'efficience énergétique, d’un système d'éclairage réglable en fonction de la luminosité extérieure et d’un système passant automatiquement en « mode nuit » lorsque les unités ne sont pas utilisées afin de contrôler et de réduire la consommation et les émissions de gaz à effet de serre.
Les dépenses environnementales définies par Euskotren couvrent plusieurs activités visant à protéger et améliorer l'environnement : traitement et gestion des déchets ; contrôle des paramètres des eaux de rejet ; gestion environnementale ; audit environnemental ; maintenance des équipements (équipements et installations avec
des impacts sur l’environnement) ; mesures de prévention de la pollution (plans d'autoprotection et mesures de prévention des fuites et des déversements).
Le programme d'investissement 2021 prévoyait l’application de mesures d'efficience énergétique dans les installations d'Ibaiondo (Vitoria-Gasteiz). Les travaux d'Ibaiondo ont été réalisés en décembre 2021 et achevés en janvier 2022.
Le Plan de gestion environnementale d'Euskotren 2021-2024 développe quant à lui la planification de l'activité environnementale pour cette période. Ce nouveau plan se concentre sur les défis que posent la gestion de l'énergie, l'économie circulaire et de gestion de l'environnement avec la réalisation d'un objectif stratégique unique de « progrès vers le développement d'une activité à faible émission de carbone et efficiente en termes de ressources ».
La gestion environnementale est déployée dans une optique d'amélioration continue conformément aux critères définis dans la norme UNE-EN-ISO 14001:2015 Systèmes de gestion environnementale, appliquée dans l'entreprise et certifiée dans l'activité de transport d’usagers par train, tramway et bus dans les installations de Lutxana, Leioa, Zumaia, au dépôt d'Elgoibar, Atxuri et Vitoria-Gasteiz.